软件工程专业2003年开始招生，2004年正式获教育部批准。2010年被评为黑龙江省重点专业，2011年被评为黑龙江省“卓越工程师教育培养计划”试点专业，2012年被评为黑龙江省“专业综合改革试点”专业。本专业参与的教研项目《面向东北老工业基地“定制式”人才培养模式的研究与实践》获国家教学成果二等奖，主持的教研项目《省级示范性软件学院人才培养模式的探索与实践》获黑龙江省高等教育教学成果一等奖。
多年来，软件工程专业积极开展校企合作，以社会需求和“主流技术岗位目标需求”为导向，以学生发展为本位，形成了“2年通识与学科基础教育，1年专业教育，1年校企联合实践培养”的“2+1+1”人才培养模式和“定制式”就业模式。本专业致力于培养具有扎实的数学、自然科学、软件工程专业基础知识和人文社会科学素质、自主学习能力、创新意识和团队合作精神，能够适应软件产业发展的需求，胜任软件系统的分析、设计、实现、测试、维护和管理等工作，成为软件工程领域具有国际视野的应用型、复合型高级人才。本专业的人才培养质量获得了学生、家长和用人单位的好评，毕业生一次就业率平均在90%以上。截止到2017年7月，软件工程专业已培养12届本科毕业生共计2600余人，现有全日制在校本科生1117人，目前许多毕业生工作在国内知名软件企业并成为业务骨干。
