2020年6月14日,软件与微电子学院青年教师姚登举为学院教师作了一场题为《非编码RNA-疾病关联预测(ncRNA-disease associations prediction)》的学术报告。姚登举老师受国家留学基金委资助于2019年3月至2020年3月赴新加坡南洋理工大学(Nanyang Technological University,NTU)计算机科学与工程学院生物医学信息学实验室进行访学,主要研究方向为生物信息学,合作导师为Kwoh Chee Keong教授。
姚老师的这次报告主要介绍了他在南洋理工大学访学期间的一项研究工作——基于随机森林的miRNA-disease关联预测算法,该研究成果被发表在生物信息学领域重要期刊《BMC Bioinformatics》上(Dengju Yao*, Xiaojuan Zhan, Chee Keong Kwoh. An improved random forest based computational model for predicting novel miRNA-disease associations. BMC Bioinformatics, 2019, 20: 624)。该研究通过集成miRNA功能相似性、疾病语义相似性、已知的miRNA-disease关联信息等生物信息数据,构建由高维特征向量表示的样本集合,并通过基于随机森林变量重要性分数的特征选择算法对样本特征空间进行降维,最后在低维特征空间构成的样本集合上训练随机森林分类器并对未知样本进行预测。实验结果表明,所提出的基于随机森林的miRNA-disease关联预测算法具有很好的预测能力,优于现有的许多优秀的miRNA-disease关联预测算法。
除了介绍在NTU的研究工作外,姚老师还向与会老师介绍了参加教育部出国留学英语培训、联系国外高校合作导师、申请国家留学基金委公派访学项目的过程以及在新加坡的学习和生活感受,为我院其他教师申请公派访学提供了有益的参考。




